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        定量蛋白質組 ? 4D-DIA定量蛋白質組學

        · 產品定義

        4D-蛋白質組學是基于timsTOF Pro質譜儀,通過捕集離子淌度(TIMS)與同步累積連續碎裂(PASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質組學研究。該技術核心是在傳統3D分離(保留時間、質荷比、離子強度)基礎上,增加肽段的碰撞截面積(CCS),實現第4維度(離子淌度)的分離檢測。 4D-DIA蛋白質組學是基于timsTOF Pro離子淌度平臺的DIA技術,通過數據非依賴采集-同步累積連續碎裂(diaPASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質組學分析。將DIA技術與基于timsTOF Pro上的diaPASEF技術相結合,具有高掃描速度和高靈敏度優勢的同時,外加第四維離子淌度分離,使DIA數據在采集時不犧牲窗口循環速度的同時,降低譜圖復雜度和提高離子利用率,實現了蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

         

        · 技術路線

        技術路線 

              

        · 技術優勢

        1. 4D技術加持,更加適合微量樣本;

        2. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制,靈活方便;

        3. 采用布魯克的timsTOF Pro質譜平臺,檢測速度提升近一倍。

         

        · 數據分析

        標準數據分析內容

        鑒定分析

        鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖

        表達差異分析

        差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖;

        多組的比較分析(組別>=3

        mufzz聚類;雷達圖;箱線圖

        功能分析

        亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析

        質量控制分析

        肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布

        高級數據分析

        功能分析

        GSEA富集分析

        臨床藥物研究

        藥物靶點注釋

        標志物篩選

        集成機器學習

        與臨床表征的聯合分析

        熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析

        關于個性化數據分析需求,請來電咨詢

         

        部分數據分析結果展示

        部分數據分析結果展示

         

        · 推薦組合產品

        大分子專屬平臺,質量與效率雙重保障:4D-DIA + 4D-DIA磷酸化蛋白質組

         

        · 推薦應用領域

        1. 藥物應答、基因敲除/過表達的蛋白表達譜分析

        2. 植物、微生物生長發育與脅迫逆境生理研究

        3. 疾病生物標志物與藥物作用靶點高通量分析

        4. 蛋白作用機制與特殊功能蛋白質篩選

        5. 各種物種的蛋白質組草圖構建

         

        · 送樣建議(特殊樣本可直接咨詢021-5466-5263/400-066-6761) 

        樣品類型

        推薦樣本量

        (新建Library

        推薦樣本量

        (不建Library

        動物組織類

        常規動物組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、皮膚等)

        30mg-2g

        15-2mg

        植物組織類

        柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本科植物,藻類,蕨類植物,大型真菌等)

        100mg-2g

        50mg-2g

        微生物類

        菌類

        50mg-2g

        20mg-2g

        細胞樣品

        懸浮/貼壁培養細胞

        1-10× 10^7

        0.5-10× 10^7

        體液樣本

        血清/血漿

        0.1ml-0.2ml

        0.05ml-0.2ml

        外泌體

        血漿(未提取外泌體)

        4ml

        2ml

        提取完成的外泌體

        50μg

        20μg

        其他類

        細胞上清

        5ml-10ml

        2ml-5ml

         

        · 參考文獻

        1. Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020.

        4D-DIA-人尿液-新冠病毒早期感染機制

        2. diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods. 2020.

        4D-DIA技術原理介紹:diaPASEF

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